Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn1Q9EPL2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms