Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms