Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms