Protein–RNA interactions for Protein: Q9D958

Spcs1, Signal peptidase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs1Q9D958 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spcs1Q9D958 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms