Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Borcs6Q9D6W8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Borcs6Q9D6W8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Borcs6Q9D6W8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms