Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zc2hc1bQ9D534 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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