Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tubgcp4Q9D4F8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms