Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H9

Dnaaf1, Dynein assembly factor 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf1Q9D2H9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Dnaaf1Q9D2H9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms