Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef12Q9D2F1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms