Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms