Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms