Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D131 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D131 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms