Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mrpl52Q9D0Y8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms