Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms