Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rhobtb3Q9CTN4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rhobtb3Q9CTN4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms