Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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