Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms