Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms