Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc5Q9CQA1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc5Q9CQA1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc5Q9CQA1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc5Q9CQA1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc5Q9CQA1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc5Q9CQA1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc5Q9CQA1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc5Q9CQA1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc5Q9CQA1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc5Q9CQA1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc5Q9CQA1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms