Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms