Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim26Q99PN3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim26Q99PN3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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