Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Smim3Q99PE5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Smim3Q99PE5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms