Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms