Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms