Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms