Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CalcbQ99MP3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CalcbQ99MP3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CalcbQ99MP3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CalcbQ99MP3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CalcbQ99MP3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CalcbQ99MP3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms