Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
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PtprtQ99M80 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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PtprtQ99M80 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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PtprtQ99M80 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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PtprtQ99M80 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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PtprtQ99M80 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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PtprtQ99M80 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
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PtprtQ99M80 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprtQ99M80 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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