Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Sh3bp5lQ99LH9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Sh3bp5lQ99LH9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Sh3bp5lQ99LH9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Sh3bp5lQ99LH9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Sh3bp5lQ99LH9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Sh3bp5lQ99LH9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Sh3bp5lQ99LH9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Sh3bp5lQ99LH9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5lQ99LH9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms