Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms