Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms