Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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