Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms