Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms