Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhb12Q91Y07 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms