Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Creb3l3Q91XE9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms