Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Setd3Q91WC0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms