Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt79Q8VED5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms