Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms