Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Hoxc12Q8K5B8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Hoxc12Q8K5B8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
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Hoxc12Q8K5B8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Hoxc12Q8K5B8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Hoxc12Q8K5B8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
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Hoxc12Q8K5B8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Hoxc12Q8K5B8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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