Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28aQ8K3Y3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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