Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms