Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Prpf39Q8K2Z2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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