Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Mtmr3Q8K296 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Mtmr3Q8K296 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Mtmr3Q8K296 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Mtmr3Q8K296 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Mtmr3Q8K296 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Mtmr3Q8K296 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr3Q8K296 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr3Q8K296 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr3Q8K296 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr3Q8K296 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr3Q8K296 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr3Q8K296 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr3Q8K296 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr3Q8K296 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr3Q8K296 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr3Q8K296 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr3Q8K296 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr3Q8K296 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr3Q8K296 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr3Q8K296 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr3Q8K296 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Mtmr3Q8K296 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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