Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms