Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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ClasrpQ8CFC7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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ClasrpQ8CFC7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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ClasrpQ8CFC7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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ClasrpQ8CFC7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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ClasrpQ8CFC7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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