Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rdh13Q8CEE7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rdh13Q8CEE7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Rdh13Q8CEE7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rdh13Q8CEE7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rdh13Q8CEE7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rdh13Q8CEE7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms