Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc178Q8CDV0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms