Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC12

Cdan1, Codanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdan1Q8CC12 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdan1Q8CC12 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms