Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBM3

Gm16223, MCG145574 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16223Q8CBM3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms