Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

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Length 810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccdc15Q8C9M2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccdc15Q8C9M2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ccdc15Q8C9M2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ccdc15Q8C9M2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ccdc15Q8C9M2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ccdc15Q8C9M2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ccdc15Q8C9M2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ccdc15Q8C9M2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ccdc15Q8C9M2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ccdc15Q8C9M2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms